L'attività editoriale attesta il lavoro svolto dalla Soprintendenza archivistica e bibliografica della Puglia nel settore degli archivi non statali della regione.
La collana curata dall'Istituto, "Quaderni della Soprintendenza Archivistica per la Puglia", è nata nel 1996 con l'obiettivo di organizzare e diffondere gli strumenti di ricerca archivistica (inventari, guide, repertori...) al fine di agevolare il lavoro dei fruitori degli archivi. Non solo strumento, dunque, di informazione tecnico scientifico, ma anche un mezzo di comunicazione tra archivisti ed utenti.
- Strumenti di gestione e di ricerca degli archivi italiani : atti delle Giornate di studio, Molfetta, 9-10 dicembre 1994 / a cura di Domenica Porcaro Massafra. - Bari : G. Laterza, 1996. - 136, [2] c. di tav. ; 25 cm. - (Quaderni della Soprintendenza archivistica per la Puglia ; 1)
- Fonti documentarie per la storia di Latiano / a cura di Rita Silvestri ; con la collaborazione dell'Archivio di Stato di Brindisi. - [S.l. : s.n.],1998 (Latiano : Neografica). - 237 p. : ill. ; 24 cm. - (Quaderni della Soprintendenza archivistica per la Puglia ; 2)
- Archivi di Principi e di Comunità : fonti per la storia di S. Vito dei Normanni : atti del Seminario di studi S. Vito dei Normanni - 13 dicembre 1996 / a cura di Domenica Porcaro Massafra. - Bari : Edipuglia, 1998. - 236 p. : ill. ; 24 cm. + 1 c. geneal. - (Quaderni della Soprintendenza archivistica per la Puglia ; 3)
- Le carte della comunità : inventario dell'archivio storico di S. Vito dei Normanni / a cura di Giovanni B. L'Abbate. - Bari : Edipuglia, 1998. - 318 p. : ill. ; 25 cm. - (Quaderni della Soprintendenza archivistica per la Puglia ; 4)
- Taviano, i documenti e la storia : inventario dell'archivio storico comunale / a cura di Maria Palasciano, Anna Maria Vernì. - Taviano : Grafema, 2000. - 397 p. : ill. ; 24 cm. - (Quaderni della Soprintendenza archivistica per la Puglia ;5)
- L'archivio storico del Comune di Bitonto : inventario dell'archivio antico, secoli 15.-19. / a cura di Eugenia Vantaggiato. - Bari : Edipuglia, 2001. - 302 p., [4] c. di tav. : ill. ; 24 cm. - (Quaderni della Soprintendenza archivistica per la Puglia ; 6)
- L'archivio storico del Comune di Bitonto : inventario del fondo postunitario / a cura di Grazia Tatò. - Bari : Edipuglia, 2000. - 236 p. : ill. : 24 cm. - (Quaderni della Soprintendenza archivistica per la Puglia ; 7).
- La selva d'oro del Cirullo monopolitano / a cura di Domenica Porcaro Massafra e Cristiana Anna Maria Guarnieri. - Bari : Edipuglia, 2002. - 330 p. : ill. ; 24 cm. - (Quaderni della Soprintendenza archivistica per la Puglia ; 8)
- Riforme in corsa...: archivi pubblici e archivi d'impresa tra trasformazioni, privatizzazioni e fusioni : atti del Convegno di studi, Bari, 17-18 giugno 2004 / a cura di Domenica Porcaro Massafra, Marina Messina e Grazia Tatò ; con la collaborazione di Angela Muscedra. - Bari : Edipuglia, 2006. - 392 p. : ill. ; 24 cm. - (Quaderni della Soprintendenza archivistica per la Puglia ; 9)
- Archivio Storico della Diocesi di Castellaneta : inventario dei fondi : Curia Vescovile e Monasteri / a cura di Carlo dell'Aquila, Francesco Antonio Bernardi ; saggi introduttivi Cosimo Damiano Fonseca, Domenica Porcaro Massafra ; inventari Francesco A. Bernardi, Adriana Bucci Morichi, Ester Trotta. - Bari : Mario Adda, 2007. - 2 v. ( p. 766 compless.) ; 24 cm. - (Quaderni della Soprintendenza archivistica per la Puglia ; 10)
- Storie di famiglie e storie di carte : l'inventario dell'archivio dei principi Dentice di Frasso / a cura di Antonella De Lucia ; prefazione di Luigi Borgia. - Lecce : Imago, 2008. - XX, 546 p. : ill. ; 24 cm. - (Quaderni della Soprintendenza archivistica per la Puglia ; 11)
- Archivio storico della Diocesi di Castellaneta : fondo Curia vescovile : inventario delle Visite pastorali / a cura di Carlo dell'Aquila ; prefazione di Pietro M. Fragnelli ; saggio introduttivo di Cosimo Damiano Fonseca ; inventario di Ester Trotta. - Bari : Adda, 2011. - XXXIV, 181 p. : ill. ; 24 cm. - (Quaderni della Soprintendenza archivistica per la Puglia ; 12) (Castellanetensis ecclesia itinera temporum ; 4)
- Archivi musicali in Puglia : tutela e valorizzazione / Mariapina Mascolo. - Bari : ANAI, 2012. - 271 p. : ill. ; 24 cm. - (Quaderni della Soprintendenza archivistica per la Puglia ; 13)
- Donne in trincea : atti del Seminario di studi, Bari, 7 marzo 2014; catalogo della Mostra / a cura di Chiara Manchisi ; prefazione: Michele Virgilio ; introduzione: Maria Carolina Nardella. - Bari : Fondazione opere laiche palatine pugliesi, 2015. - 116 p. : ill. ; 30 cm. - (Quaderni della Soprintendenza archivistica per la Puglia ; 14)
- Niccolò De Bellis : un intellettuale meridionale del Novecento : biografia, iconografia, archivio / a cura di Cristiana Carlucci e Giuseppe Domenico Netti ; prefazione di Bruno Brunetti ; introduzione e coordinamento scientifico di Maria Pia Pontrelli ; interventi di Giovanni Fraccascia, Dino Posa, Maria Spinelli. - Bari : Stilo, 2016. - 165 p. : ill. ; 24 cm. - (Storia e territorio) (Quaderni Soprintendenza archivistica della Puglia e della Basilicata ; 15).
- L’archivio della chiesa Maria Santissima Annunziata di Modugno (secc. 15.-20.). - Bari : Ecumenica, 2018-2019. - 3 volumi ; 30 cm. - (Quaderni d'archivio / a cura di Nicola Colatorti). - (Quaderni della Soprintendenza archivistica e bibliografica della Puglia e della Basilicata ; 16)
Sull’attività editoriale della Soprintendenza fino al 2009 vedi : A. Muscedra, L’attività editoriale della Soprintendenza archivistica per la Puglia, in Archivi, a. IV, n. 2 (luglio-dicembre 2009), pp. 107-125.